As Tartarugas Mutantes Ninja e o Time Sete derrotaram as forças mutantes do Clã do Pé, mas a batalha está longe de terminar: usando o poder do ooze, Oroku Saki abandonou sua humanidade e se transformou no monstruoso Destruidor. Em busca de vingança contra a Vila da Grande Maçã, cabe aos nossos heróis acabar com o caminho de destruição do Destruidor e desafiar o ciclo de ódio que o consome. A luta que você tanto esperava finalmente chegou — Naruto vs. Destruidor!